Nommé en 1977 substitut puis premier substitut près le tribunal de grande instance de Pontoise, Jean-claude Marin a ensuite occupé les fonctions de chef du service juridique et de secrétaire général de la commission des marchés à terme de marchandises de 1985 à février 1988.

Premier substitut puis chef de la section financière du parquet de tribunal de grande instance de Paris, il est devenu en janvier 1995 Procureur de la République adjoint en charge de la division économique et financière et a contribué à la création du pôle financier auprès de cette juridiction.

Nommé le 2 mai 2001 avocat général à la chambre criminelle de la Cour de cassation, puis Directeur des affaires criminelles et des grâces au Ministère de la Justice en août 2002, il devient Procureur de la République de Paris de 2004 à 2011 avant d’occuper les fonctions de Procureur général près la Cour de cassation depuis le 16 septembre 2011.